Перестройка судебной системы страны началась в первый же день Великой Отечественной войны. Условия военного времени потребовали незамедлительного укрепления государственной дисциплины и общественного порядка и мобилизации всех сил общества.

Так, 22 июня 1941 года Указом Президиума Верховного Совета СССР был принят закон «О военном положении», который изменил подсудность военных трибуналов. В развитие данного Указа Президиумом Верховного Совета был принят еще один Указ «Об утверждении Положения о военных трибуналах в местностях, объявленных на военном положении, и в районах военных действий».

Таким образом, в военные годы в СССР свою деятельность осуществляли 2 вида судебных органов: военные трибуналы и народные суды (суды общей юрисдикции).

На основании ст.57 Закона о судоустройстве СССР военные трибуналы действовали при военных округах, фронтах и морских флотах, при армиях, корпусах, иных воинских соединениях и военизированных учреждениях. Согласно этому положению, линейные суды железнодорожного и водного транспорта реорганизовывались Народным комиссариатом юстиции СССР в военные трибуналы соответствующих железных дорог и водных путей сообщения.

Между тем в связи с объявлением осадного положения в части территорий СССР и расширением подсудности военных трибуналов Народный комиссариат юстиции СССР и его органы на местах приступили к активному расширению численности военных трибуналов, а также к реорганизации народных и других общих судов в местностях, объявленных на осадном положении, в военные трибуналы. По мере освобождения от врага советской территории военные трибуналы вновь стали преобразовываться в краевые (областные) и народные суды, а органы юстиции продолжали осуществлять в отношении них судебное управление как прежде в мирное время.

В местностях, объявленных на военном положении, расширялась подсудность военных трибуналов. Все дела о преступлениях, направленных против обороны, общественного порядка и государственной безопасности, были изъяты из ведения общих судебных органов и переданы в военные трибуналы. Сохранилась подсудность народных судов и в области общеуголовного преступления. Военные власти имели право передавать в военные трибуналы дела о злостном хулиганстве, спекуляции и иных преступлениях.

 Дела в военных трибуналах рассматривались постоянными судьями без участия народных заседателей. Приговоры трибуналов, действовавших в местностях, объявленных на военном положении, и в районах военных действий, не подлежали кассационному обжалованию.

Эффективно организованная судебная система и система государственного управления в целом стала важным фактором победоносного окончания войны.

Судьи в период Великой Отечественной войны выполняли не только сложную государственную работу по отправлению правосудия, многие из них принимали непосредственное участие в боевых операциях Вооруженных Сил.

Также на военные годы пришлась и разработка ряда инструкций, регулирующих деятельность народных судов. В частности, в самый разгар Великой Отечественной войны (июль 1943 г.) была принята Инструкция по делопроизводству в народном суде, которая впервые ввела единый порядок делопроизводства в судебной системе СССР. В ней был определен порядок ведения номенклатуры дел, журналов их учета, соответствующих нарядов по различным направлениям деятельности судов, по организации приема посетителей, направлению извещений и повесток, оформление дел, обращение к исполнению судебных решений, порядок ведения архива и его списание, распределение обязанности между работниками аппарата суда, учет отчетов судей перед избирателями и проводимой ими общественной работы и другая повседневная деятельность народного суда.

Судебная система Чкаловской области

В период с июня 1941 года по май 1945 года судебная система Чкаловской области включала в себя:

- Военный трибунал войск МВД (НКВД) по Чкаловской области

- Военный трибунал Оренбургской железной дороги

- Чкаловский областной суд

- 79 судебных участков народных судей в г. Чкалове и Чкаловской области